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設立國家人類基因組定序研究團隊以對抗新型冠狀病毒

 

1. 全國性研究將測試新冠病毒的遺傳易感性

2. 將定序上千組新冠患者的基因組,以了解基因組如何影響對病毒的反應

3. 英國基因組 (Genomics England) 與愛丁堡大學共同領導研究尋找新療法

數以千計的重症新冠患者參與遺傳研究,幫助科學家了解基因是否會影響對該病毒的易感性。

 

NHS將進行一項重大的人類全基因組定序研究 (human whole genome sequencing),研究對象包括目前以及曾在新冠重症病房中治療的20,000名病患,以及15,000名輕度或中度症狀者。英國基因組與GenOMICC、Illumina和NHS攜手合作以執行這項涵蓋全英170個重症病房患者的研究。

 

這項計畫由英國基因組、英國研究創新局 (UK Research and Innovation, UKRI),衛生與社會部門 (Department of Health and Social Care) 以及國家衛生研究院 (National Institute for Health Research) 挹注2800萬英鎊支持。 而Illumina則將定序35,000個基因組,並以實物捐助1 (in-kind contribution) 分擔費用。

 

在愛丁堡大學和多家NHS醫院的推動下,這項研究將探討新冠病毒對患者的影響,藉由辨識高風險患者來尋找治療方法,並加速新療法引入臨床試驗。

 

衛生和社會健康部長 (Health and Social Care Secretary) 馬特漢考克(Matt Hancock)說:「隨著時間的推移,我們越來越了解此病毒,也了解到基因組成如何影響人們的反應,是解決問題的核心關鍵。這是一項深具意義與開創性的研究,將以英國世界領先的基因科學來改善治療方法,最終挽救全世界的生命。」

 

由於遺傳研究需要大量患者,因此GenOMICC最終旨在招募每位曾在英國接受重症治療的新冠患者。只有在患者本人或其近親的同意下,患者才可參加研究。至今,此研究已採集了2,000名患者的DNA樣本。

 

英國基因組執行長克里斯威格利 (Chris Wigley) 說:「我們很自豪能與NHS和其他夥伴一起抵禦新冠病毒,並了解感染後的不同反應。很高興能夠利用我們在100,000個基因組計劃中的經驗,及對基因組研究和醫療保健的承諾,為國家做出貢獻。」

 

英國基因組將從成千上萬的新冠重症者的基因組或遺傳藍圖中讀取數據,並與僅出現輕度症狀的患者比較。

 

領導這項研究的愛丁堡大學首席研究員肯尼思貝利博士(Kenneth Baillie)說:「基因在決定誰可能發展成重症中,扮演了重要角色。了解基因有助於選擇臨床試驗的治療方法。 GenOMICC研究是在疫情爆發前啟動的,在重症照護社群的支持下,目前正在全國160個加護病房進行招募。很榮幸和英國基因組合作來應對這個新型且複雜的疾病。」

 

這個計畫希望結合具臨床特徵的基因組並比較重症與輕症者的情況,來了解病毒如何影響我們。

 

此開創性的研究將有助於解釋為什麼某些新冠患者只有輕度症狀,有些發展成重症,而有些會死於此疾病。

 

發現哪些人容易有致命症狀,將能在臨床試驗中找到最佳的治療方法,並偵測新冠患者是否處於危險中。

 

這項對人類基因組定序的工作,是接續3月宣布的英國冠狀病毒定序計劃(UK COVID-19 Viral Sequencing Programme, COG-UK),該工作由英國公共衛生部門 (Public Health England) 和桑格研究所(Sanger Institute)主持,已對該病毒基因組進行定序。

 

英國基因組首席科學家馬克考菲爾德爵士教授(Professor Sir Mark Caulfield)說:「在這一代首次面臨的大流行中,對某些人來說是生命威脅,有些人則是輕度感染。通過閱讀基因組,或能找出影響新冠病毒反應的變異、減少傷害、挽救生命甚至防止未來爆發的新療法。」

 

Illumina將在英國劍橋的實驗室進行定序,他們已於該實驗室與英國基因組和NHS成功完成了100,000個基因組計劃。

 

Illumina於歐洲、中東、及非洲地區(EMEA)總經理兼副總裁寶拉多迪(Paula Dowdy)說:「我們與英國基因組長期合作,我們很自豪能在我們位於劍橋的實驗室執行這項計劃。研究結果將建立一個平台,以了解人類對新冠病毒的反應,從而為控制感染擴散提供新方法。」

 

今天的公告展示了英國世界領先的基因組社群共同努力,以全面了解該病毒的傳播與影響。

 

由NHS、英國公共衛生機構 (包括UKRI)、桑格研究所和英國學術中心所組成的新冠病毒基因組學英國聯盟(COVID-19 Genomics UK Consortium, COG-UK),可將人類基因組的數據與先前宣布的病毒基因組數據連結起來。

COG-UK主任夏儂皮克 (Sharon Peacock) 教授說:「此研究是英國基因組界如何共同努力獲取病毒傳播和影響的完整基因組圖的範例。我們COG-UK已定序了來自新冠患者10,000多個病毒基因組。Genomics England-GenOMICC則將這些數據與患者基因組數據聯繫起來,以了解其中的交互作用如何影響患者對感染的反應,並改善我們對未來疾病的因應策略。」

 

英國研究創新局執行長馬克沃爾波特爵士教授(Professor Sir Mark Walport)提供了300萬英鎊資助此項計畫。他說:「英國是全球基因分析領導者,以專業來檢視遺傳因素在新冠病毒中的作用,包括在無潛在健康問題的年輕重症者中的作用,來確定重要的風險因子和疾病機制,從而發現新的診斷和治療方法。」

 

部分研究將著重於受新冠病毒嚴重影響的兒童和年輕人。

 

國家衛生研究院生物資源 (NIHR BioResource)、GenOMICC和英國基因組公司提供設備、專業和100萬英鎊資金對年輕患者及父母採樣。

 

國家衛生研究院生物資源首席研究員約翰布萊德 (John Bradley) 教授說:「 國家衛生研究院生物資源很高興與英國基因組合作,並與GenOMICC 研究為什麼某些兒童和年輕人會嚴重受到新冠病毒影響。」

 

英國國民健康署與提昇部門(NHS England and NHS Improvement)首席科學官蘇西爾夫人 ( Professor Dame Sue Hill) 教授說:「此研究可提高我們對新冠病毒的理解以及潛在的基因組差異是否有其作用:為什麼有些人症狀輕微而有些人則病得很重。在這充滿挑戰的時刻,我對參與研究的所有人員、患者和家屬深表感謝。」

 

研究期間所收集的數據將為全球策略規劃提供依據以因應未來可能的大流行或新流行。但在這研究前景之下我們仍應遵守政府指導,待在家裡保持安全。

 

注:實物捐助 (in-kind contribution) 指的是以金錢以外的方式提供協助。

 

譯自英國研究創新局 (UKRI) 2020年5月13日

https://www.ukri.org/news/new-partnership-to-sequence-human-genomes-in-the-fight-against-coronavirus/

更新日期 : 2020/07/03