免疫治療法(Immunotherapy)近年來用在治療癌症頗具功效，原理是經由人體之免疫系統自行標示出癌細胞製造出之特殊腫瘤新生抗原(neoantigens)，能精準辨識癌細胞然後清除。同時還能保障人體免疫系統不會將正常細胞錯殺為腫瘤細胞。免疫治療法能讓免疫系統正確辨認腫瘤新生抗原，強化免疫反應。因此，標靶出對抗腫瘤細胞之新生抗原，是免疫治療法之成功關鍵。
截至現今，辨識腫瘤新生抗原仍主要仰賴電腦演算模型預測，而非直接針對生物體抗原進行量測，因此，在辨識腫瘤新生抗原研發來說，仍有極大精進空間。為此，免疫學界研發免疫胜肽組(immunopeptidomics)平台，用來量測所有抗原結構，以利更準確標定腫瘤新生抗原，精進免疫治療法效果。
腫瘤疫苗之基本概念來自免疫學家藉由人工仿造腫瘤新生抗原來組成微型胜肽(peptides)結構刺激免疫功能反應，啟動免疫系統並且消滅腫瘤細胞。具體地說，免疫學家將人工仿造抗原用在T細胞治療、製造mRNA疫苗或注射人體來刺激免疫反應，就能標定出腫瘤細胞、啟動免疫系統、清除腫瘤細胞。而免疫系統只要一啟動，便可自行繼續辨識並清除特定腫瘤細胞，產生療效。
由於不同腫瘤會產生不同腫瘤新生抗原，而在不同病患身上，腫瘤會產生不同腫瘤新生抗原。如何在個別病患體內啟動自主免疫系統標示及清除其所帶腫瘤細胞，是客製化精準腫瘤免疫療法之精隨。因此，比利時法蘭德斯科技研究院(Flemish Institute for Technological Research, VITO)試著以結腸癌(Colon Cancer)為研發前導計畫－ImmunoPepX計畫，希望研發可標定各種腫瘤新生抗原之模型，以利推廣到其他腫瘤治療。
ImmunoPepX計畫獲比利時「法蘭德斯創新與創業機構」(Flanders Innovation & Entrepreneurship, VLAIO)補助。由VITO主導，與比利時荷語魯汶大學(KU Leuven)、比利時荷語布魯塞爾自由大學(VUB)、楊森藥廠(Janssen pharmaceutical company)以及新創公司myNEO組成聯合團隊，發展腫瘤新生抗原免疫胜肽組學分析平台，透過生物資訊技術，分析免疫相關胜肽。預期可精準偵測單一性腫瘤新生抗原，啟動免疫細胞反應。
胜肽組學與蛋白組學(proteomics)相似，前者研究細胞或者器官內胜肽與其特徵，後者研究對象為蛋白質，分析胜肽或蛋白質可各自解析胜肽或蛋白質之冰山一角。惟蛋白組學透過已知基因預測蛋白質結構，可預測冰山大小，肽組學則因缺乏基因體(genome)資訊尚無法預測。VITO胜肽組學研究團隊認為標定腫瘤新生抗原有如海裡撈針，需仰賴超高解析度與靈敏度檢測方式。因此VITO研究團隊在蛋白組學檢測基礎搭配檢測分子質譜儀(mass spectrometers)，發展出免疫胜肽組學研究平台。之前，研究團隊已花費數年提升儀器檢測靈敏度，補足超高解析度胜肽組研究平台－ImmunoPepX之需求。
VITO研究團隊將以15例結腸癌病患之臨床資訊建立包含DNA、RNA、蛋白質組、免疫胜肽組與相關免疫反應等相關大數據之資料庫。未來可研發演算法標定腫瘤新生抗原來驗證成果。未來驗證過之演算法可用於其他腫瘤或傳染性疾病之偵測，提升客製化免疫醫療法之精準度。
特約編輯: 黃筠安
參考資料：
