捷克科學院有機化學與生物化學研究所(IOCB)的科研團隊,成功開發出一項具突破性的高效核酸適體(Aptamer)篩選技術。該方法整合了多個生物化學與生物資訊學步驟,為全新的診斷與治療應用開闢了康莊大道。例如,此技術可用於開發穿戴式感測器,以即時監測體內特定的生物標記(biomarker)濃度,並針對潛在的健康併發症發出即時預警。
研究成果已發表於《Nature Communications》期刊。
核酸適體是由短鏈 DNA 或 RNA 組成的分子,能以極高的專一性辨識並結合特定的標的分子。與抗體類似,它們可用於偵測分子或調節其活性。然而,相較於抗體,核酸適體具有更高的穩定性、可透過化學合成製備,並能根據需求進行精準的化學修飾,進而展現許多抗體無法實現的優異特性。
隨著市場對精準且快速診斷工具的需求日益增加,核酸適體在許多應用場景中,展現出比傳統抗體更佳的優勢。然而,核酸適體的開發過程通常相當耗時且實驗步驟繁瑣,往往需要跨領域專家的協同合作。如今,由 Marek Ondruš 與 Michal Hocek 帶領的捷克科學院 IOCB 研究團隊,已開發出一項能顯著縮短整體研發時程的新技術。
第一作者 Marek Ondruš 博士表示: 「開發核酸適體往往如同大海撈針。在包含數兆種不同 DNA 序列的庫(library)中,我們必須篩選出唯一能與標的分子強烈且專一結合的特定序列。我們的新方法能先篩選出『適體家族(aptamer families)』——即數百條具備相似特徵的關聯序列,再從中鑑別出實驗表現最佳的成員。這項技術成功將開發時間從數個月大幅縮短至僅需數天。」
研究團隊亦進一步拓展了核酸適體的應用潛力。他們對適體的基本構件(building blocks)進行化學修飾,引入了全新的官能基(這些官能基在自然界中常見於胺基酸等分子)。
透過此方法製備的分子,完美融合了 DNA 與蛋白質(抗體)雙方的優勢:其序列由 DNA 的鹼基排列決定,而多樣化的化學修飾則顯著提升了適體辨識重要生物標的的能力,使其能模擬蛋白質特有的分子交互作用(此類作用為眾多生物機制的核心關鍵)。
研究團隊以人體胰島素受體(human insulin receptor),調控血糖的核心蛋白質作為此新方法的概念驗證標的。他們成功開發出一種能高度專一性結合該受體的適體,並利用冷凍電子顯微鏡(cryo-EM)詳細解析了兩者結合的分子結構機制。
Marek Ondruš 總結指出: 「我們證實了透過化學修飾引入的官能基,不僅在適體與蛋白質的專一性辨識與複合物形成中扮演要角,對於穩定 DNA 適體本身的二級結構也具有關鍵作用。這項研究成果為如何利用經化學修飾的核酸來模擬蛋白質特性,提供了全新的科學視角。」
在未來,這項新技術有望輔助甚至取代現有以抗體為基礎的臨床診斷工具。目前,研究團隊正與專責技術轉移的子機構 IOCB Tech 密切合作,持續推進該技術的後續商業化與應用開發,期盼能加速將此項創新科研成果導入產業與臨床醫學領域。
*本篇新聞來源為捷克Independent information about science and research網站