為因應國際科技趨勢及擘劃國家未來科技發展策略，行政院啟動科技部組織調整，將科技部由縱向執行部會轉型為橫向協調整合之國家科學及技術委員會，主任委員並由政務委員兼任，國家科學及技術委員會組織法並於民國111年7月27日生效。
轉型後之國科會除承受科技部原有業務外，將連接上中下游的技術發展與產業應用，聚焦我國策略布局，並發揮跨域、跨部會協調功能，集中科技發展事務權責，並妥善分配科技經費、優化使用效率，確保政策有效執行。
民國48年2月1日行政院國家科學委員會成立，為政府推動科學技術發展的專責機構，肩負推動全國整體科技發展、支援學術研究，以及發展科學園區等三大任務。另為強化科技創新與產業發展結合以帶動經濟成長和國家進步，民國103年3月3日國科會改制為科技部。
新國科會職掌包括國家科學發展、技術研究與應用政策之綜合規劃、協調、審議及資源分配；國家科學發展、技術研究與應用計畫之綜合規劃、協調、審議、資源分配及管理考核；基礎及應用科技研究之推動；重大科技研發計畫及支援學術研究之推動；產業前瞻技術研發與學研新創政策之綜合規劃、協調及推動；科學園區發展之規劃及推動；行政院國家科學技術發展基金之管理；其他有關科學發展、技術研究及應用事項。
本會設主任委員1人、政務副主任委員2人、常務副主任委員1人、主任秘書1人，本會單位設有綜合規劃處、自然科學及永續研究發展處、工程技術研究發展處、生命科學研究發展處、人文及社會科研究發展處、科教發展及國際合作處、前瞻及應用科技處、產學及園區業務處、秘書處、人事處、主計處、政風處及資訊處等13個處，科技辦公室及法規會2個任務編組，本會有新竹科學園區管理局、中部科學園區管理局及南部科學園區管理局3個所屬機關，另主管行政法人國家災害防救科技中心、行政法人國家太空中心、財團法人國家實驗研究院、財團法人國家同步輻射研究中心等4個法人單位。
