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本會鼓勵執行機構以管理費支應專題研究計畫主持人及相 關研究人員之心理健康服務相關費用。
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本會補助專題研究計畫於執行中，如有計畫主持人或共同主持人之職稱變更、計畫主持人或共同主持人之任職系所變更、以及協同研究人員或計畫參與人員變更等情事，免報本會
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「科技部補助專題研究計畫因應嚴重特殊傳染性肺炎作業指引」及109年3月4日科部綜字第1090013875號函示因受疫情影響之經費報支原則，自即日起停止適用
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本會補助專題研究計畫內國外來臺博士級專任人員機票費報支規定
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101年9月18日臺會綜二字第1010063125號函，自即日起停止適用。
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教育人員於留職停薪期間申請及執行本會補助專題研究計畫
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102年4月19日臺會綜二字第1020023472號函，自即日停止適用。
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98年6月9日臺會綜二字第0980039325號函等14則解釋函，自即日起停止適用
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本會補助之專題研究計畫執行後如有應繳回款項，請採匯款方式辦理繳庫，可便利就近繳納、有助縮短入庫時程並簡化行政作業
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因執行本會補助專題研究計畫所給付人事相關費用，如依全民健康保險法規定須計收執行機構(投保單位)補充保險費，除給付助理人員費用衍生之補充保險費於計畫業務費列支，其他給付費用衍生之補充保險費由計畫管理費分攤列支
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因執行本會補助專題研究計畫赴國外移地研究及出席國際學術會議，卻因故無法成行，其自行辦理手續已支付之手續費或委託旅行業辦理出國事宜所衍生之賠償旅遊費用等，如確屬不可歸責於當事人之事由，經貴機構本從嚴原則予以認定者，得於計畫原核定國外差旅費內檢據覈實報支，101年11月22日臺會綜二字第1010077060號函，自即日起停止適用
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因執行本會補助專題研究計畫赴國外從事實驗、田野調查、採集樣本等移地研究衍生計畫所需交通租金費用，得報經本會同意後於國外差旅費內檢據覈實報支
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重申補助專題研究計畫作業要點第三點第一項第一款規定所指「編制內」按月支給待遇之專任人員認定條件及私立大學專任教學、研究人員年齡限制乙事
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執行補助專題研究計畫需要進行人體試驗或問卷調查等，而提供受試者參與費、營養費、檢測費、實驗受測費、問卷施測費等相關報酬支付方式
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執行補助專題研究計畫已辦理終止執行或縮短執行期限(含提前結束)者，管理費須按執行月數比例計算，自即日起實施
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為提升我國科研競爭力及發揮科研經費運用效能，補助專題研究計畫自101年10月26日起於業務費項下匡列彈性支用額度
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執行補助專題研究計畫報支出席費等具酬勞性質之費用辦理原則
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為加強補助專題研究計畫經費結報及研究成果(含期中進度、期末及出國心得)報告管理，自102年2月1日起全面實施專題研究計畫經費結報及研究成果報告繳交管理措施
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